上海崇明东滩湿地生态系统国家定位观测研究站（以下简称“崇明东滩站”）由复旦大学和上海市崇明东滩鸟类自然保护区管理处共同建立，其前身为复旦大学生物多样性科学研究所于1998年设立的“长江河口湿地生态系统野外科学观测研究站”，是我国较早开展长江河口湿地生态系统定位观测研究的专业机构之一。2000年，复旦大学正式发文，批准建设长江河口湿地生态系统野外科学观测研究站。2013年6月，获国家林业局批准建设崇明东滩站。

       自1998年建站以来，崇明东滩站围绕河口湿地生物多样性、生态系统组成、结构与功能、生物入侵和湿地可持续利用等开展了一系列工作，发表了大量高水平论文和出版了较多著作，尤其值得指出的是，通过对崇明东滩湿地和九段沙湿地的系统调研，成功帮助上海获批两个国家级自然保护区；作为一个野外平台，崇明东滩站也帮助培养了一代又一代生态学、植物学及动物学的硕士研究生和博士研究生，并且接纳了国内外的众多客座研究人员和访问交流人员；针对崇明东滩湿地的重要生态问题-互花米草入侵，在站科研人员系统评估了入侵危害，并且提出了六字治理方针，为世界上特大型入侵种控制和湿地恢复工程的规划提供了科学证据和决策性建议，这一重大成果得到了焦点访谈的专题报道；针对互花米草入侵导致的土著种海三棱藨草几乎灭绝情况，在站科研人员开展了种群重建和复壮，通过组培、小试和中试，成功恢复了堤内和堤外海三棱藨草种群，为候鸟提供了良好的栖息地和食物来源；崇明东滩站也是突出的科普教育机构，无论是针对中小大学生，还是针对社区，开展了多种形式的科普活动，包括湿地课堂、节日宣传、社区共建等，宣传湿地重要性，助力湿地保护。